MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptomyces hygroscopicus subsp. jinggangensis 5008 plasmid pSHJG2

Total Repeats: 1720

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016972	CG	3	6	35	40	0 %	0 %	50 %	50 %	386836022
2	NC_016972	ACC	2	6	80	85	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836022
3	NC_016972	GCC	2	6	93	98	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836022
4	NC_016972	TGC	2	6	173	178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836022
5	NC_016972	GC	3	6	244	249	0 %	0 %	50 %	50 %	386836022
6	NC_016972	CCCGC	2	10	275	284	0 %	0 %	20 %	80 %	386836022
7	NC_016972	GGAACC	2	12	291	302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836022
8	NC_016972	TCC	2	6	320	325	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836022
9	NC_016972	TGG	2	6	336	341	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836022
10	NC_016972	GAC	2	6	347	352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836022
11	NC_016972	CG	3	6	380	385	0 %	0 %	50 %	50 %	386836022
12	NC_016972	GGC	2	6	386	391	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836022
13	NC_016972	GGC	2	6	398	403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836022
14	NC_016972	CGG	2	6	411	416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836022
15	NC_016972	GTG	2	6	423	428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836022
16	NC_016972	CTC	2	6	435	440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836022
17	NC_016972	GCG	2	6	441	446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836022
18	NC_016972	GGT	2	6	455	460	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836022
19	NC_016972	TCG	3	9	514	522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836022
20	NC_016972	CGG	2	6	537	542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836022
21	NC_016972	CGG	2	6	549	554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836022
22	NC_016972	GCT	2	6	579	584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836022
23	NC_016972	CCG	2	6	623	628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836022
24	NC_016972	ACC	2	6	631	636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836022
25	NC_016972	GCC	2	6	648	653	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836022
26	NC_016972	GAA	2	6	674	679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386836022
27	NC_016972	GGC	2	6	714	719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836022
28	NC_016972	GGT	2	6	764	769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836022
29	NC_016972	GTCC	2	8	810	817	0 %	25 %	25 %	50 %	386836022
30	NC_016972	GGT	2	6	818	823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836022
31	NC_016972	CG	3	6	853	858	0 %	0 %	50 %	50 %	386836022
32	NC_016972	CTCGG	2	10	946	955	0 %	20 %	40 %	40 %	386836022
33	NC_016972	GGC	2	6	958	963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836022
34	NC_016972	TGG	2	6	975	980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836022
35	NC_016972	TGA	2	6	1003	1008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386836022
36	NC_016972	GTCG	2	8	1032	1039	0 %	25 %	50 %	25 %	386836022
37	NC_016972	TCG	2	6	1046	1051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836022
38	NC_016972	GCG	3	9	1064	1072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836022
39	NC_016972	CGG	2	6	1079	1084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836022
40	NC_016972	ACG	2	6	1161	1166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836022
41	NC_016972	GCA	2	6	1194	1199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836022
42	NC_016972	TG	3	6	1223	1228	0 %	50 %	50 %	0 %	386836022
43	NC_016972	GCGG	2	8	1264	1271	0 %	0 %	75 %	25 %	386836022
44	NC_016972	CGG	2	6	1279	1284	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836022
45	NC_016972	GGCC	2	8	1285	1292	0 %	0 %	50 %	50 %	386836022
46	NC_016972	CCT	2	6	1304	1309	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836022
47	NC_016972	CCT	2	6	1534	1539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836022
48	NC_016972	GAG	2	6	1578	1583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836022
49	NC_016972	GCT	2	6	2914	2919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836023
50	NC_016972	CCG	2	6	2943	2948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836023
51	NC_016972	CCT	2	6	3004	3009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836023
52	NC_016972	CGCC	2	8	3015	3022	0 %	0 %	25 %	75 %	386836023
53	NC_016972	GAC	2	6	3059	3064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836023
54	NC_016972	GGC	2	6	3103	3108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836023
55	NC_016972	CCGG	3	12	3149	3160	0 %	0 %	50 %	50 %	386836023
56	NC_016972	CGG	2	6	3165	3170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836023
57	NC_016972	CGT	2	6	3174	3179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836023
58	NC_016972	GCA	2	6	3231	3236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836023
59	NC_016972	TCCT	2	8	3307	3314	0 %	50 %	0 %	50 %	386836023
60	NC_016972	ACCCGC	2	12	3375	3386	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	386836024
61	NC_016972	CGGC	2	8	3477	3484	0 %	0 %	50 %	50 %	386836024
62	NC_016972	TG	3	6	3502	3507	0 %	50 %	50 %	0 %	386836024
63	NC_016972	CAG	2	6	3515	3520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836024
64	NC_016972	TTC	2	6	3527	3532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386836024
65	NC_016972	GAA	2	6	3674	3679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386836024
66	NC_016972	CTG	3	9	3710	3718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836024
67	NC_016972	CG	3	6	3752	3757	0 %	0 %	50 %	50 %	386836024
68	NC_016972	GCC	2	6	3765	3770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836024
69	NC_016972	TTC	2	6	3771	3776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386836024
70	NC_016972	CCT	2	6	3781	3786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836024
71	NC_016972	CGCC	2	8	3800	3807	0 %	0 %	25 %	75 %	386836024
72	NC_016972	GCCGC	2	10	3808	3817	0 %	0 %	40 %	60 %	386836024
73	NC_016972	TCC	2	6	3825	3830	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836024
74	NC_016972	CCG	2	6	3836	3841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836024
75	NC_016972	CCT	2	6	3856	3861	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836024
76	NC_016972	CCA	2	6	3905	3910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836024
77	NC_016972	CGT	2	6	3922	3927	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836024
78	NC_016972	CCG	2	6	3983	3988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836024
79	NC_016972	GA	3	6	3996	4001	50 %	0 %	50 %	0 %	386836024
80	NC_016972	TCCAC	2	10	4033	4042	20 %	20 %	0 %	60 %	386836024
81	NC_016972	CCGG	2	8	4062	4069	0 %	0 %	50 %	50 %	386836024
82	NC_016972	CGG	2	6	4108	4113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836024
83	NC_016972	CACTC	2	10	4117	4126	20 %	20 %	0 %	60 %	386836024
84	NC_016972	GC	3	6	4129	4134	0 %	0 %	50 %	50 %	386836024
85	NC_016972	ACCC	2	8	4172	4179	25 %	0 %	0 %	75 %	386836024
86	NC_016972	GCGG	2	8	4241	4248	0 %	0 %	75 %	25 %	386836024
87	NC_016972	TCC	2	6	4254	4259	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836024
88	NC_016972	GCA	2	6	4383	4388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836024
89	NC_016972	CAG	2	6	4415	4420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836024
90	NC_016972	ACG	2	6	4453	4458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836024
91	NC_016972	GGT	2	6	4471	4476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836024
92	NC_016972	CCG	2	6	4521	4526	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836024
93	NC_016972	GTC	2	6	4595	4600	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836024
94	NC_016972	GCC	2	6	4615	4620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836024
95	NC_016972	CAGT	2	8	4639	4646	25 %	25 %	25 %	25 %	386836024
96	NC_016972	GGT	2	6	5196	5201	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836025
97	NC_016972	TGA	2	6	5204	5209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386836025
98	NC_016972	GC	3	6	5210	5215	0 %	0 %	50 %	50 %	386836025
99	NC_016972	CTG	2	6	5287	5292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836025
100	NC_016972	ATC	2	6	5299	5304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386836025
101	NC_016972	CCGG	2	8	5863	5870	0 %	0 %	50 %	50 %	386836026
102	NC_016972	GCT	2	6	5906	5911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836026
103	NC_016972	CAC	2	6	5927	5932	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836026
104	NC_016972	GAG	2	6	5940	5945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836026
105	NC_016972	GGC	2	6	6077	6082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836026
106	NC_016972	GCG	2	6	6155	6160	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836026
107	NC_016972	CTG	2	6	6168	6173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836026
108	NC_016972	CAG	2	6	6261	6266	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836026
109	NC_016972	GC	3	6	6278	6283	0 %	0 %	50 %	50 %	386836026
110	NC_016972	GC	3	6	6310	6315	0 %	0 %	50 %	50 %	386836026
111	NC_016972	GGGCA	2	10	6351	6360	20 %	0 %	60 %	20 %	386836026
112	NC_016972	CGGC	2	8	6362	6369	0 %	0 %	50 %	50 %	386836026
113	NC_016972	GCC	2	6	6384	6389	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836026
114	NC_016972	GCC	2	6	6409	6414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836026
115	NC_016972	GAC	2	6	6438	6443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836026
116	NC_016972	CCG	2	6	6486	6491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836026
117	NC_016972	TTC	2	6	6504	6509	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386836026
118	NC_016972	CCG	3	9	6544	6552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836026
119	NC_016972	GGA	2	6	6563	6568	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836026
120	NC_016972	TGC	2	6	6586	6591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836026
121	NC_016972	GAG	2	6	6663	6668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836026
122	NC_016972	CAG	3	9	6741	6749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836026
123	NC_016972	GTAA	2	8	6811	6818	50 %	25 %	25 %	0 %	386836026
124	NC_016972	CCGGG	2	10	7226	7235	0 %	0 %	60 %	40 %	386836027
125	NC_016972	GCG	2	6	7258	7263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836027
126	NC_016972	TGC	2	6	7270	7275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836027
127	NC_016972	GC	3	6	7274	7279	0 %	0 %	50 %	50 %	386836027
128	NC_016972	CCG	2	6	7308	7313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836027
129	NC_016972	TCC	2	6	7392	7397	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836027
130	NC_016972	GCG	2	6	7426	7431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836027
131	NC_016972	GGC	2	6	7438	7443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836027
132	NC_016972	GCCG	2	8	7504	7511	0 %	0 %	50 %	50 %	386836027
133	NC_016972	AGG	2	6	7525	7530	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836027
134	NC_016972	CAG	2	6	7544	7549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836027
135	NC_016972	CAC	2	6	7586	7591	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836027
136	NC_016972	GC	3	6	7596	7601	0 %	0 %	50 %	50 %	386836027
137	NC_016972	TGG	3	9	7603	7611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836027
138	NC_016972	C	6	6	7657	7662	0 %	0 %	0 %	100 %	386836027
139	NC_016972	CGG	2	6	7699	7704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836027
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253	NC_016972	CG	3	6	12455	12460	0 %	0 %	50 %	50 %	386836032
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258	NC_016972	TGGCCG	2	12	12702	12713	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	386836033
259	NC_016972	GCCG	2	8	12814	12821	0 %	0 %	50 %	50 %	386836033
260	NC_016972	GAG	2	6	12833	12838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386836033
261	NC_016972	GCCTG	2	10	12897	12906	0 %	20 %	40 %	40 %	386836033
262	NC_016972	TCTGT	2	10	12908	12917	0 %	60 %	20 %	20 %	386836033
263	NC_016972	CG	4	8	13069	13076	0 %	0 %	50 %	50 %	386836033
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265	NC_016972	CAG	2	6	13091	13096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836033
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270	NC_016972	CGA	2	6	13253	13258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836034
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391	NC_016972	TCG	4	12	20115	20126	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836040
392	NC_016972	GCG	2	6	20187	20192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836040
393	NC_016972	GCG	2	6	20208	20213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836040
394	NC_016972	GTG	2	6	20234	20239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836040
395	NC_016972	GGT	2	6	20266	20271	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836040
396	NC_016972	GCCG	2	8	20276	20283	0 %	0 %	50 %	50 %	386836040
397	NC_016972	CTG	2	6	20312	20317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836040
398	NC_016972	GGT	2	6	20339	20344	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836040
399	NC_016972	TCC	2	6	20367	20372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836040
400	NC_016972	CCT	3	9	20425	20433	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386836040
401	NC_016972	GTC	3	9	20526	20534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836041
402	NC_016972	CGG	2	6	20538	20543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836041
403	NC_016972	GCCGG	2	10	20545	20554	0 %	0 %	60 %	40 %	386836041
404	NC_016972	TCG	2	6	20563	20568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836041
405	NC_016972	ATGG	2	8	20616	20623	25 %	25 %	50 %	0 %	386836041
406	NC_016972	GGC	2	6	20629	20634	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836041
407	NC_016972	GTC	2	6	20754	20759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836041
408	NC_016972	AGCC	2	8	20820	20827	25 %	0 %	25 %	50 %	386836041
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410	NC_016972	TTC	2	6	20897	20902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386836042
411	NC_016972	CGG	3	9	20908	20916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836042
412	NC_016972	CGG	2	6	20941	20946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836042
413	NC_016972	GCG	2	6	20958	20963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836042
414	NC_016972	TCG	2	6	20973	20978	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836042
415	NC_016972	TCGC	2	8	21009	21016	0 %	25 %	25 %	50 %	386836042
416	NC_016972	CGGTG	2	10	21067	21076	0 %	20 %	60 %	20 %	386836042
417	NC_016972	GCT	2	6	21172	21177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836042
418	NC_016972	CGG	2	6	21189	21194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836042
419	NC_016972	CGC	2	6	21196	21201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836042
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421	NC_016972	GGC	2	6	21284	21289	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836042
422	NC_016972	CAG	2	6	21296	21301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836042
423	NC_016972	CGG	2	6	21316	21321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836042
424	NC_016972	GGT	2	6	21335	21340	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836042
425	NC_016972	TGC	2	6	21354	21359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386836042
426	NC_016972	GGC	2	6	21362	21367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836042
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428	NC_016972	GGC	2	6	21395	21400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836042
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430	NC_016972	GGT	2	6	21482	21487	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836042
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432	NC_016972	CGG	2	6	21548	21553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836042
433	NC_016972	CATCTC	2	12	21654	21665	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	386836043
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436	NC_016972	GGGC	2	8	21710	21717	0 %	0 %	75 %	25 %	386836043
437	NC_016972	TGG	2	6	21766	21771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386836043
438	NC_016972	GGCG	2	8	21839	21846	0 %	0 %	75 %	25 %	386836043
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450	NC_016972	CTGTC	2	10	22302	22311	0 %	40 %	20 %	40 %	386836043
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452	NC_016972	CCG	2	6	22429	22434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836043
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454	NC_016972	GCG	2	6	22618	22623	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836043
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456	NC_016972	CGG	2	6	22647	22652	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836043
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474	NC_016972	GCC	2	6	23345	23350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836045
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480	NC_016972	CCG	2	6	23529	23534	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	386836045
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484	NC_016972	CG	4	8	23673	23680	0 %	0 %	50 %	50 %	386836045
485	NC_016972	GCG	2	6	23726	23731	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836045
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491	NC_016972	CG	3	6	23918	23923	0 %	0 %	50 %	50 %	386836045
492	NC_016972	CGA	2	6	23931	23936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836045
493	NC_016972	CGG	2	6	24022	24027	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836045
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496	NC_016972	CCGG	2	8	24162	24169	0 %	0 %	50 %	50 %	386836045
497	NC_016972	CGA	2	6	24201	24206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386836045
498	NC_016972	GAA	2	6	24244	24249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386836045
499	NC_016972	CCA	2	6	24307	24312	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386836045
500	NC_016972	GGC	2	6	24342	24347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386836045

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